介绍并分析了网络测量和控制系统的精确时钟同步协议IEEE 1588，通过与目前应用广泛的网络时间协议（NTP）相比较，指出其高精度时钟同步实现机制的特殊性。针对IEC 61850所定义的过程总线上采样值高精度同步要求，提出了一种基于IEEE 1588的合并单元同步实现的新方案。在此方案中，利用现场可编程门阵列(FPGA)对IEEE 1588同步报文时标生成点进行精确确定，IEEE 1588同步协议的实现利用微控制器完成。