简要分析了电子式互感器和保护控制设备接口的相关国际标准，指出合并单元的设计是实现此接口的关键因素。就遵循IEC 61850-9-1标准设计合并单元时所面临的同步问题，分析了需具体实现的功能，并提出了一种利用现场可编程逻辑门阵列器件解决的新方法。此方法在准确、可靠判断同步输入时钟脉冲上升沿后进行多路电流、电压同步采样，在同步输入时钟受到干扰或短时丢失时，可对其进行实时跟踪和判断，从而在输入时钟恢复正常后实现合并单元的快速同步。软件仿真和实验结果均证明了此方法的有效性。