提出了利用短窗Morlet复小波计算工频电信号基波与各次谐波信号幅值的算法，其频率特性和计算值的稳定性都优于傅里叶算法。计算结果受频率波动影响小，对谐波有较强的抑制作用。短窗Morlet复小波算法的时间窗为1个～3个周期，全周期复小波算法的计算量与全周期傅里叶算法完全相同，因此，也是一种快速算法。通过算例验证了短窗Morlet复小波算法的效果，并应用于实验室变压器合闸过程的励磁涌流分析，结果证明了该算法的优越性。该算法可供继电保护的不同需求选择。