中性点非有效接地配电系统大多只安装两相电流互感器，其接地选线问题是长期困扰实际运行的技术难题。为了解决只装有两相电流互感器配电系统的单相接地选线问题，在分析了中性点非有效接地配电系统接地所产生的电流行波特征的基础上，提出了基于两相初始电流行波和小波变换的接地选线新算法。该算法仅仅利用接地时所产生的两相行波，不受中性点接地方式和系统正常运行时不平衡电流的影响，解决了现场的实际运行需要。仿真和试验结果验证了所提出的方法的可靠性和有效性。