电力系统继电保护的最小二乘算法由于采用的噪声模型不同而有多种形式。文中首先列举了最小二乘算法的各种模型及其组合，通过研究算法模型对滤波性能的影响，提出采用IH（平均最大频谱）和IL分别评估算法滤除谐波分量的能力和滤除非周期分量的能力。使用该方法对各种噪声模型进行了对比研究，并得到了各种时间窗长度下的对于电压和电流信号的最佳模型。仿真计算表明所提出的比较方法及其结果是正确的。最后，基于得到的最小二乘算法的最佳模型，提出了一种基于最小二乘算法的快速距离保护。